2010年底，南京电子商务协会筹备组成立，由南京市商务局指导，苏宁易购、焦点科技、宏图三胞、好享购、途牛旅游网等参与组建。

2011年1月21日，南京电子商务协会正式成立，江苏省商务厅潘宪生副厅长、南京市人民政府李琦副市长等领导出席成立大会。